Astaksantinas yra raudonas pigmentas, esantis daugelyje natūralių organizmų.Natūralus astaksantinasdaugiausia randama jūrų organizmuose, kurie skiriasi nuo chlorofilo ir karotino sausumos augaluose. Tai yra tam tikra mikrodumblių forma, kurią vartoja daugybė skirtingų vandens organizmų rūšių. Dėl stiprios raudonos astaksantino pigmentacijos šių gyvūnų mėsa arba kiautai būna raudoni arba rausvi.
Raudonoji lašiša, randama laukiniame Ramiajame vandenyne, yra viena didžiausių koncentracijųnatūralus astaksantinas, išskyrus H. Pluvialį. Šis pigmentas suteikia žuvies mėsai ikonišką sodriai raudoną spalvą ir neįtikėtinai sveikų antioksidacinių savybių. Kiti natūralūs astaksantino šaltiniai yra omarai, arktinės krevetės, krabai, vėžiai, raudonieji upėtakiai, dumbliai ir kriliai. Raudoni paukščiai dažniausiai įgauna spalvą valgydami žuvį ir augalus, kuriuose gausuastaksantinas, tačiau jų pigmento koncentracija paprastai yra maža.
Nors jūros gyvybė yra labiausiai paplitęs šaltinisnatūralus astaksantinas, tai neapsiriboja vandens augalais ir gyvūnais. Pavyzdžiui, mielėse, vadinamose Xanthophyllomyces dendrorhous (Phaffia mielės), taip pat yra gana daug astaksantino. Tai astaksantino gamintojas. Jis neįsisavins jo iš kitų organinių šaltinių.
